Conference abstract
Aspects épidémiologiques de la co-infection des virus Influenza et SARS-CoV-2 au cours de la pandémie à COVID-19 à Yaoundé, Cameroun
Pan African Medical Journal - Conference Proceedings. 2023:18(11).03
Oct 2023.
doi: 10.11604/pamj-cp.2023.18.11.2056
Archived on: 03 Oct 2023
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Keywords: Influenza, grippe, SARS-CoV-2, COVID-19, RT-PCR, co-infection
Oral presentation
Aspects épidémiologiques de la co-infection des virus Influenza et SARS-CoV-2 au cours de la pandémie à COVID-19 à Yaoundé, Cameroun
Mohamadou Ripa Njankouo1,&, Monamele Chavely Gwladys1, Moumbeket Yifomnjou Henri Moise1, Tchatchouang Serges1, Messanga Landry1, Fatawou Modiyinji Abdou1, Tagnouokam Ngoupo Paul Alain1, Njouom Richard1
1Centre Pasteur du Cameroun, Yaoundé, Cameroun
&Auteur correspondant
Introduction: la COVID-19 causée par le SARS-COV-2 est un syndrome respiratoire dont certains symptômes et l’épidémiologie sont similaires à ceux de la grippe. Il est donc important d’étudier la circulation des virus grippaux et SARS-COV-2 afin de fournir des données probantes qui permettront d’orienter les politiques de surveillance de ces virus. L’objectif de cette étude était de décrire l’épidémiologie moléculaire de la co-infection virus Influenza et SARS-CoV-2 au cours de la pandémie à COVID-19 à Yaoundé.
Méthodes: dans une étude prospective transversale, des écouvillons nasaux et nasopharyngés ont été collectés sur des patients présentant des syndromes grippaux pendant la période allant de juillet 2021 à février 2022 à Yaoundé au Cameroun. Ces échantillons ont été analysés au laboratoire de virologie du Centre Pasteur du Cameroun par la technique de RT-PCR triplex en temps réel, qui permet de détecter à la fois les virus grippaux (Influenza A et B) et le SARS-CoV-2. Le sous-typage des cas positifs Influenza A ou B a été réalisé en utilisant une RT-PCR multiplex développée par le Centers for Disease Control and Prevention.
Résultats: au total, 767 prélèvements ont été effectués et les résultats de RT-PCR ont montré que 107 (14%) étaient positifs au Covid-19 et 129 (16,8%) positifs à Influenza avec une prédominance des virus influenza A (108 soit 83,7%). Au sous-typage, 74 (57,3%) étaient des virus A/H1N1pdm09; 34 (26,3%) A/H3N2 et 20 (15,5%) des virus B/Victoria. Un cas (0.6%) de co-infection par les virus Influenza A/H3N2 et B/Victoria a été identifié. Par contre aucun cas de co-infection par les virus Influenza et SARS-CoV-2 n’a été identifié.
Conclusion: les résultats de cette étude montrent une co-circulation des virus Influenza et SARS-CoV-2 pendant la pandémie à COVID-19. Cependant aucun cas de co-infection entre les deux virus n’a été identifié. Il serait nécessaire de faire une analyse sur un échantillonnage plus important et représentatif de la population pour confirmer ces résultats.
Aspects épidémiologiques de la co-infection des virus Influenza et SARS-CoV-2 au cours de la pandémie à COVID-19 à Yaoundé, Cameroun
Mohamadou Ripa Njankouo1,&, Monamele Chavely Gwladys1, Moumbeket Yifomnjou Henri Moise1, Tchatchouang Serges1, Messanga Landry1, Fatawou Modiyinji Abdou1, Tagnouokam Ngoupo Paul Alain1, Njouom Richard1
1Centre Pasteur du Cameroun, Yaoundé, Cameroun
&Auteur correspondant
Introduction: la COVID-19 causée par le SARS-COV-2 est un syndrome respiratoire dont certains symptômes et l’épidémiologie sont similaires à ceux de la grippe. Il est donc important d’étudier la circulation des virus grippaux et SARS-COV-2 afin de fournir des données probantes qui permettront d’orienter les politiques de surveillance de ces virus. L’objectif de cette étude était de décrire l’épidémiologie moléculaire de la co-infection virus Influenza et SARS-CoV-2 au cours de la pandémie à COVID-19 à Yaoundé.
Méthodes: dans une étude prospective transversale, des écouvillons nasaux et nasopharyngés ont été collectés sur des patients présentant des syndromes grippaux pendant la période allant de juillet 2021 à février 2022 à Yaoundé au Cameroun. Ces échantillons ont été analysés au laboratoire de virologie du Centre Pasteur du Cameroun par la technique de RT-PCR triplex en temps réel, qui permet de détecter à la fois les virus grippaux (Influenza A et B) et le SARS-CoV-2. Le sous-typage des cas positifs Influenza A ou B a été réalisé en utilisant une RT-PCR multiplex développée par le Centers for Disease Control and Prevention.
Résultats: au total, 767 prélèvements ont été effectués et les résultats de RT-PCR ont montré que 107 (14%) étaient positifs au Covid-19 et 129 (16,8%) positifs à Influenza avec une prédominance des virus influenza A (108 soit 83,7%). Au sous-typage, 74 (57,3%) étaient des virus A/H1N1pdm09; 34 (26,3%) A/H3N2 et 20 (15,5%) des virus B/Victoria. Un cas (0.6%) de co-infection par les virus Influenza A/H3N2 et B/Victoria a été identifié. Par contre aucun cas de co-infection par les virus Influenza et SARS-CoV-2 n’a été identifié.
Conclusion: les résultats de cette étude montrent une co-circulation des virus Influenza et SARS-CoV-2 pendant la pandémie à COVID-19. Cependant aucun cas de co-infection entre les deux virus n’a été identifié. Il serait nécessaire de faire une analyse sur un échantillonnage plus important et représentatif de la population pour confirmer ces résultats.
