Conference abstract
Analyse de la performance de trois tests rapides de dépistage antigène du SARS-CoV-2 comparés au test d´amplification d´acide nucléique au Laboratoire National de Santé Publique
Pan African Medical Journal - Conference Proceedings. 2023:18(15).03
Oct 2023.
doi: 10.11604/pamj-cp.2023.18.15.2061
Archived on: 03 Oct 2023
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Keywords: Evaluation, TDR, SARS-CoV-2, performances
Oral presentation
Analyse de la performance de trois tests rapides de dépistage antigène du SARS-CoV-2 comparés au test d´amplification d´acide nucléique au Laboratoire National de Santé Publique
Nguwoh Philippe Salomon1,&, Akenji Mboringong Blaise1, Taheu Ngounouh Christian2, Ibrahima Halilou1, Madie Tamo Corine2, Mpiwouo Panyere Guianni3, Pefouakeu Pepa Solange1, Tayimetha Yanique Carolle1, Ngantchui Tchuisseu Jerôme4, Bit Younouss Al-Mayé Amina1, Nafissatou Ibnou Moussa1, Ngo Likeng Julienne-Louise5, Ngomtcho Sen Claudine Henriette1, Essomba Réné Ghislain1, Okomo Assoumou Marie-Claire1
1Laboratoire National de Santé Publique (LNSP), Yaoundé, Cameroun, 2Institut Supérieur des Sciences et Techniques Appliquées à la Santé, Yaoundé, Cameroun, 3Institut Universitaire la Fraternité, Yaoundé, Cameroun, 4Action for One Health, Yaoundé, Cameroun, 5École des sciences de la Santé de l´Université Catholique d´Afrique Centrale, Yaoundé, Cameroun
&Auteur correspondant
Introduction: la stratégie de riposte contre la COVID-19 est basée sur les Tests d’Amplification d’Acide Nucléique et le dépistage délocalisé (reposant sur les tests de diagnostics rapides antigéniques). Avec le nombre de personnes à tester, seulement deux TDR pré-qualifiés et vérifiés au Cameroun sont utilisés avec des pics de rupture enregistrée. L’objectif était d’analyser les performances de trois tests de diagnostic rapide du coronavirus 2 Comparé au test moléculaire dans deux districts de santé de Yaoundé.
Méthodes: dans cette étude transversale, descriptive et de précision diagnostic nous avons recruté les participants âgés d’au moins 21ans après obtention d’une clairance éthique. De façon consécutive deux prélèvements nasopharyngés ont été réalisés pour chaque participant l’un dans le milieu de transport virologique pour la PCR et l’autre dans le tampon d’extraction pour le TDR-Ag (®SURE STATUS, ®ORIENT GENE ET ®COVIOS). Ces tests de diagnostics rapides antigéniques ont été comparés au test PCR DAAN GENE. L’analyse statistique des données a été réalisé à l’aide du logiciel SPSS version 17 ; pour toutes les valeurs P<0,05 était considéré comme statiquement significative.
Résultats: sur 556 participants enrôlés, 83(14,93%) étaient positifs à l’ARN SARS-CoV-2 et 38(6,83%) aux tests de diagnostics rapides antigènes SARS-CoV-2. Les sensibilités des TDR-Ag étaient de 36,54% (23,62%-51,04%) ; 18,75% (4,05%-45,65%); 66,67% (38,38%-88,18%) respectivement pour ®SURE STATUS; ®ORIEN GENE; ET ®COVIOS. Cette sensibilité est passée à 64,71% (38,71%-85,79%); 20% (0,51%-71,64%); 72,73% (39,09%-93,98%) lorsque la valeur du cycle seuil était > 25. Le k de Cohen a montré une concordance faible entre ®SURE STATUS, ®ORIEN GENE et la PCR respectivement K=0,40 et K=0,25. Cependant il a montré un accord fort entre le TDR®COVIOS et la PCR.
Conclusion: les TDR®COVIOS ET ®SURE STATUS avaient des sensibilités situées dans l’intervalle recommandé par l’OMS Lorsque le cycle seuil était inférieur à 25. Ces tests pourraient être utilisés comme alternative des TDR existant dans l’algorithme du dépistage COVID-19.
Analyse de la performance de trois tests rapides de dépistage antigène du SARS-CoV-2 comparés au test d´amplification d´acide nucléique au Laboratoire National de Santé Publique
Nguwoh Philippe Salomon1,&, Akenji Mboringong Blaise1, Taheu Ngounouh Christian2, Ibrahima Halilou1, Madie Tamo Corine2, Mpiwouo Panyere Guianni3, Pefouakeu Pepa Solange1, Tayimetha Yanique Carolle1, Ngantchui Tchuisseu Jerôme4, Bit Younouss Al-Mayé Amina1, Nafissatou Ibnou Moussa1, Ngo Likeng Julienne-Louise5, Ngomtcho Sen Claudine Henriette1, Essomba Réné Ghislain1, Okomo Assoumou Marie-Claire1
1Laboratoire National de Santé Publique (LNSP), Yaoundé, Cameroun, 2Institut Supérieur des Sciences et Techniques Appliquées à la Santé, Yaoundé, Cameroun, 3Institut Universitaire la Fraternité, Yaoundé, Cameroun, 4Action for One Health, Yaoundé, Cameroun, 5École des sciences de la Santé de l´Université Catholique d´Afrique Centrale, Yaoundé, Cameroun
&Auteur correspondant
Introduction: la stratégie de riposte contre la COVID-19 est basée sur les Tests d’Amplification d’Acide Nucléique et le dépistage délocalisé (reposant sur les tests de diagnostics rapides antigéniques). Avec le nombre de personnes à tester, seulement deux TDR pré-qualifiés et vérifiés au Cameroun sont utilisés avec des pics de rupture enregistrée. L’objectif était d’analyser les performances de trois tests de diagnostic rapide du coronavirus 2 Comparé au test moléculaire dans deux districts de santé de Yaoundé.
Méthodes: dans cette étude transversale, descriptive et de précision diagnostic nous avons recruté les participants âgés d’au moins 21ans après obtention d’une clairance éthique. De façon consécutive deux prélèvements nasopharyngés ont été réalisés pour chaque participant l’un dans le milieu de transport virologique pour la PCR et l’autre dans le tampon d’extraction pour le TDR-Ag (®SURE STATUS, ®ORIENT GENE ET ®COVIOS). Ces tests de diagnostics rapides antigéniques ont été comparés au test PCR DAAN GENE. L’analyse statistique des données a été réalisé à l’aide du logiciel SPSS version 17 ; pour toutes les valeurs P<0,05 était considéré comme statiquement significative.
Résultats: sur 556 participants enrôlés, 83(14,93%) étaient positifs à l’ARN SARS-CoV-2 et 38(6,83%) aux tests de diagnostics rapides antigènes SARS-CoV-2. Les sensibilités des TDR-Ag étaient de 36,54% (23,62%-51,04%) ; 18,75% (4,05%-45,65%); 66,67% (38,38%-88,18%) respectivement pour ®SURE STATUS; ®ORIEN GENE; ET ®COVIOS. Cette sensibilité est passée à 64,71% (38,71%-85,79%); 20% (0,51%-71,64%); 72,73% (39,09%-93,98%) lorsque la valeur du cycle seuil était > 25. Le k de Cohen a montré une concordance faible entre ®SURE STATUS, ®ORIEN GENE et la PCR respectivement K=0,40 et K=0,25. Cependant il a montré un accord fort entre le TDR®COVIOS et la PCR.
Conclusion: les TDR®COVIOS ET ®SURE STATUS avaient des sensibilités situées dans l’intervalle recommandé par l’OMS Lorsque le cycle seuil était inférieur à 25. Ces tests pourraient être utilisés comme alternative des TDR existant dans l’algorithme du dépistage COVID-19.
